RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 LINC00471Q8N535 108 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SNX18Q96RF0 628 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF382Q96SR6 550 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MAGEH1Q9H213 219 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 BCL9O00512 1426 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ADM5C9JUS6 153 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA12O60330 932 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 KLK1P06870 262 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SRCP12931 536 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 HOXD10P28358 340 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SHMT2P34897 504 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SOX3P41225 446 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GALNT2Q10471 571 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CDK10Q15131 360 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 KLBQ86Z14 1044 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF384Q8TF68 577 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RELTQ969Z4 430 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 COQ8BQ96D53 544 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 UROC1Q96N76 676 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR51J1Q9H342 316 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GLTPQ9NZD2 209 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVI7 797 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PRKYO43930 277 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GMDSO60547 372 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RBBP9O75884 186 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PDGFAP04085 211 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 NAT1P18440 290 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 COQ5Q5HYK3 327 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CYS1Q717R9 158 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GRHL3Q8TE85 626 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PIP5K1AQ99755 562 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OAZ2O95190 189 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 EBLN1P0CF75 366 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ALDH3B2P48448 385 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 HCAR3P49019 387 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TAS2R43P59537 309 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SH3BP2P78314 561 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ESCO2Q56NI9 601 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SLC5A8Q8N695 610 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 LRR1Q96L50 414 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF599Q96NL3 588 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.45□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TVP23AA6NH52 213 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 STBD1O95210 358 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 VAMP2P63027 116 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 KCNC4Q03721 635 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 STK11Q15831 433 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SPIN4Q56A73 249 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR10G6Q8NH81 332 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RAB8BQ92930 207 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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