RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 LMLNQ96KR4 655 aa15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF38Q9H0F5 515 aa15.77■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ACP5P13686 325 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 F8A1P23610 371 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 18.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LMAN2Q12907 356 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 WACQ9BTA9 647 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPB11Q9Y547 144 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 KRBA1A5PL33 1030 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNA7P01567 189 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LCKP06239 509 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GADD45AP24522 165 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM124AQ86V42 546 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR26Q9H7D7 661 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 DRGXA6NNA5 263 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 NOTOA8MTQ0 251 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDN4O14493 209 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SOD2P04179 222 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ATF6P18850 670 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ACVR2AP27037 513 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 VEZF1Q14119 521 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 XKRXQ6PP77 449 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 OSTF1Q92882 214 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GLYATL1Q969I3 302 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR83Q9NYM4 423 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF3P17036 446 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 MATN1P21941 496 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CXCR4P61073 352 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP3R1P63098 170 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF366Q8N895 744 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ARMC5Q96C12 935 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 INPP5KQ9BT40 448 aa15.76■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMP1P11279 417 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TYRP14679 529 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT77Q7Z794 578 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC5A8Q8N695 610 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SPACA7Q96KW9 195 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TDP1Q9NUW8 608 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA3DO95025 777 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 IL3P08700 152 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GRK6P43250 576 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC157Q569K6 752 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 APIPQ96GX9 242 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM30A4D0T7 59 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM25EA8MYX2 175 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 MMP20O60882 483 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GSRP00390 522 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNA6P05013 189 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM189BP81408 668 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR68Q15743 365 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 PELI3Q8N2H9 469 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SOBPA7XYQ1 873 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ETFAP13804 333 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF24P17028 368 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CELP19835 753 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA3BQ13214 749 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 VITQ6UXI7 678 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CD180Q99467 661 aa15.75■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 K7ERQ8 282 aa15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 LEFTY2O00292 366 aa15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ALPLP05186 524 aa15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 IFI30P13284 250 aa15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH3B2P48448 385 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms