RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf52Q96A22 123 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF559Q9BR84 538 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CUEDC2Q9H467 287 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087X0K7 114 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEB16A2A368 324 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MU76 341 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ANHXE9PGG2 379 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GLCEO94923 617 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 OXTRP30559 389 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ETV5P41161 510 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 BACE1P56817 501 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP10-5P60370 271 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ASIC1P78348 528 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GCKRQ14397 625 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 C3AR1Q16581 482 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC38Q5VT99 294 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CLYBLQ8N0X4 340 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 RASL10AQ92737 203 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SOSTQ9BQB4 213 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ACPTQ9BZG2 426 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 TTI1O43156 1089 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CRCPO75575 148 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF19O95750 216 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 HPRP00739 348 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-13P01766 116 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPN2P17655 700 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ACKR3P25106 362 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GJB2P29033 226 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 LMO4P61968 165 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT83P78385 493 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC34A1Q06495 639 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC3A1Q07837 685 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SLMAPQ14BN4 828 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC1A5Q15758 541 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP14Q86W24 1093 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PHC2Q8IXK0 858 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ELMOD1Q8N336 334 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PANX3Q96QZ0 392 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 FUT8Q9BYC5 575 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GNB4Q9HAV0 340 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK13Q9HB14 408 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CNIH4Q9P003 139 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ETV7Q9Y603 341 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ACEP12821 1306 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF749O43361 778 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT7O43581 403 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ODC1P11926 461 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SKILP12757 684 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ACADSP16219 412 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5DP30049 168 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGR2CP31995 323 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINB6P35237 376 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP4BP51164 291 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PRELPP51888 382 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYBA2P53672 197 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 DSCR10P59022 87 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 COX10Q12887 443 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ACKR1Q16570 336 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms