RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 GPC1P35052 558 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 ELK3P41970 407 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 TLE4Q04727 773 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF460Q14592 562 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 GALNT7Q86SF2 657 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM156Q8N614 296 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 C14orf79Q96F83 325 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM10Q96HG1 83 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 FAR2Q96K12 515 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 AICDAQ9GZX7 198 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.65□□□□□ -0.86
CLRN3-201ENST00000368671 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SERPINA6P08185 405 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PPP2R1BP30154 601 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 RIPPLY3P57055 190 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 RUNX2Q13950 521 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 MDGA2Q7Z553 956 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CDH24Q86UP0 819 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 FAM47BQ8NA70 645 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NCLNQ969V3 563 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 VMP1Q96GC9 406 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC77Q9BR77 488 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.64□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 USP27XA6NNY8 438 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CAPN3P20807 821 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 GDF5P43026 501 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SSR4P51571 173 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 RAB38P57729 211 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PLGLB1Q02325 96 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SLC13A2Q13183 592 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 BMPR2Q13873 1038 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PDIK1LQ8N165 341 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 OARD1Q9Y530 152 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PSAT1Q9Y617 370 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 ITPR2Q14571 2701 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 CREBBPQ92793 2442 aa9.63□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NOTCH2Q04721 2471 aa9.62□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 PINLYPA6NC86 204 aa9.62□□□□□ -0.87
CLRN3-201ENST00000368671 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms