RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368530.6

TPM3-210, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPM3, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-210ENST00000368530 RPA4Q13156 261 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 STX5Q13190 355 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RIPK1Q13546 671 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IL23RQ5VWK5 629 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ATCAYQ86WG3 371 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 OR56A3Q8NH54 315 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ZNF480Q8WV37 535 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TEX37Q96LM6 180 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ACTL8Q9H568 366 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 MRGBPQ9NV56 204 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SNX6Q9UNH7 406 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.5□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 H0Y3Z8 333 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 NRP2O60462 931 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SEC22BO75396 215 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SLC22A3O75751 556 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CD22P20273 847 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CAPN3P20807 821 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IDSP22304 550 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 GNLYP22749 145 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PNLIPRP1P54315 467 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 EMX2Q04743 252 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 DOC2AQ14183 400 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 KCNAB1Q14722 419 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 NADK2Q4G0N4 442 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 METRNLQ641Q3 311 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 HPS6Q86YV9 775 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 NUDT8Q8WV74 236 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CDRT15Q96T59 188 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ACPTQ9BZG2 426 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 ANGPT2O15123 496 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SEMA7AO75326 666 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 SH3BGRLO75368 114 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CEACAM4O75871 244 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 KRT36O76013 467 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 WFS1O76024 890 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 G6PDP11413 515 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PCNAP12004 261 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IL12AP29459 219 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CASP2P42575 452 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 KCNK10P57789 538 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 PSME3P61289 254 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 DMPKQ09013 629 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IL10RAQ13651 578 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 UGT8Q16880 541 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 FRG2Q64ET8 278 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CPZQ66K79 652 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 IRGCQ6NXR0 463 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TPM3-210ENST00000368530 RETREG3Q86VR2 466 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms