RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 FITM2Q8N6M3 262 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 STON2Q8WXE9 905 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TSSK6Q9BXA6 273 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 NINQ8N4C6 2090 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RAB28P51157 221 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CBLBQ13191 982 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 FUZQ9BT04 418 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GGT3PA6NGU5 568 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SCELO95171 688 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 IFNGR1P15260 489 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 LSSP48449 732 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CD97P48960 835 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SLC11A1P49279 550 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SQSTM1Q13501 440 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 NPRL2Q8WTW4 380 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 KCNK12Q9HB15 430 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 FBP2O00757 339 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PLSCR1O15162 318 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RAD1O60671 282 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ENTPD6O75354 484 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RAB36O95755 333 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ATF6P18850 670 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ACVR1BP36896 505 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PRR22Q8IZ63 422 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ZNF516Q92618 1163 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ITM2CQ9NQX7 267 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 VNN1O95497 513 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GTF2F2P13984 249 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TPTEP56180 551 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR4D2P58180 307 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CNTD1Q8N815 330 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 S100PBPQ96BU1 408 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SARDHQ9UL12 918 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ATE1O95260 518 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MAS1P04201 325 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GPIP06744 558 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GNB3P16520 340 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GLP1RP43220 463 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PNLIPRP1P54315 467 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR9A1PQ8NGU1 263 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MND1Q9BWT6 205 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PTGS2P35354 604 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ZNF84P51523 738 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 LTC4SQ16873 150 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CDNFQ49AH0 187 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TMBIM1Q969X1 311 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SDSLQ96GA7 329 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PGAM5Q96HS1 289 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CCDC28BQ9BUN5 200 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 BTNL10A8MVZ5 291 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 H3BUI4 141 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GALTP07902 379 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 G6PDP11413 515 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CSF2RAP15509 400 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SSTP61278 116 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PON3Q15166 354 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 WDR45Q9Y484 360 aa10.19□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms