RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 MYOCQ99972 504 aa20.39■□□□□ 0.86
GTPBP6-201ENST00000326153 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.39■□□□□ 0.86
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SUV39H1O43463 412 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 DDCP20711 480 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 FPR1P21462 350 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RAB28P51157 221 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MAPK12P53778 367 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ITGA1P56199 1179 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PPP2CBP62714 309 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PPP2CAP67775 309 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CTBSQ01459 385 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RNF130Q86XS8 419 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PLD3Q8IV08 490 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MPP4Q96JB8 637 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCG4Q9H172 646 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.39■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC16A6O15403 523 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC31A1O15431 190 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OR1F1O43749 312 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 HOXB2P14652 356 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 IL7RP16871 459 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 IGFBP5P24593 272 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PKLRP30613 574 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SERPINB1P30740 379 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 FADDQ13158 208 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RFX4Q33E94 735 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ZBED5Q49AG3 693 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SDE2Q6IQ49 451 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 GPR141Q7Z602 305 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 DOHHQ9BU89 302 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CA14Q9ULX7 337 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.38■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SCAMP1O15126 338 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CRHBPP24387 322 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RAD23AP54725 363 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ISL1P61371 349 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SELENOWP63302 87 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CD47Q08722 323 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PMS2P3Q13401 168 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 MEP1AQ16819 746 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF691Q5VV52 312 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 BAG5Q9UL15 447 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 DPM1O60762 260 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OPN1SWP03999 348 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ITGAMP11215 1152 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 ESRRGP62508 458 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 RBBP4Q09028 425 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 FZD5Q13467 585 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SCARB2Q14108 478 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.37■□□□□ 0.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms