RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MCHR1Q99705 422 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PREPP48147 710 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS10Q8TAM1 723 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 FNTBP49356 437 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 VMACQ2NL98 169 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD4Q8IY51 512 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TSGA13Q96PP4 275 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GVI7 797 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf27AQ580R0 203 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NOXRED1Q6NXP6 359 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NEIL3Q8TAT5 605 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR45Q9Y484 360 aa23.3■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 EDNRBP24530 442 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NRIP1P48552 1158 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SCLYQ96I15 445 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PIP5K1AQ99755 562 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DOHHQ9BU89 302 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 FAAHO00519 579 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 AOC2O75106 756 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PDYNP01213 254 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 STT3AP46977 705 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CARM1Q86X55 608 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SCML4Q8N228 414 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CD300LFQ8TDQ1 290 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR88Q9GZN0 384 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 VNN3Q9NY84 501 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GJA1P17302 382 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PROZP22891 400 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF5Q13568 498 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 BIRC8Q96P09 236 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF696Q9H7X3 374 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SIX4Q9UIU6 781 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR3EA5X5Y0 456 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GP1BBP13224 206 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.29■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQY0 241 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PLGP00747 810 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NPR2P20594 1047 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS19P49795 217 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A25Q6KCM7 469 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCA1A8K7I4 914 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MOAP1Q96BY2 351 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN14A8MX76 684 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND6BQ8NEG7 585 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM41AQ96HV5 264 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MKS1Q9NXB0 559 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 IL7P13232 177 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CCL14Q16627 93 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 LIPJQ5W064 366 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 THRSPQ92748 146 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 SNED1Q8TER0 1413 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GLOD5A6NK44 160 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALT2O60909 372 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAM1Q15629 374 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NAXEQ8NCW5 288 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTL8Q9H568 366 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 EBF1Q9UH73 591 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK6Q9Y257 313 aa23.28■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2C1P13056 603 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CELP19835 753 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 GLP1RP43220 463 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKCZQ05513 592 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8K3Q8NH51 312 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 NSMAFQ92636 917 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 OARD1Q9Y530 152 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0U1RQF3 1178 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 XKR8Q9H6D3 395 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C2Y5 167 aa23.27■■□□□ 1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 MT-ND2P03891 347 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms