RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 DMTF1Q9Y222 760 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GVT2 93 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PR77 199 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CLIC1O00299 241 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GSTA4O15217 222 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FURINP09958 794 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 C7P10643 843 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SOAT1P35610 550 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GRK3P35626 688 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TBCELQ5QJ74 424 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 C18orf63Q68DL7 685 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NETO1Q8TDF5 533 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NELL1Q92832 810 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2E3Q969T4 207 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TM4SF18Q96CE8 201 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RHBGQ9H310 441 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 REEP4Q9H6H4 257 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RMND5AQ9H871 391 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR6C2Q9NZP2 312 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SERTM1A2A2V5 107 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PGRMC2O15173 223 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ACPPP15309 386 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CXCR2P25025 360 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ALDH4A1P30038 563 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HPCAL1P37235 193 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 BTN3A2P78410 334 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HSPB3Q12988 150 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 LPAL2Q16609 132 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 AAGABQ6PD74 315 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DNAJC9Q8WXX5 260 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RNF145Q96MT1 663 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CIB1Q99828 191 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CEP192Q8TEP8 1941 aa10.45□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 A0A096LPI6 279 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DHRS12A0PJE2 317 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 KCNJ13O60928 360 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ENPP1P22413 925 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ARPC4P59998 168 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PHEXP78562 749 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SLAMF1Q13291 335 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NKG7Q16617 165 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB134Q4QY38 66 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FCRL6Q6DN72 434 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR2I1PQ8NGU4 316 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CLDN23Q96B33 292 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NELL2Q99435 816 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FAM60AQ9NP50 221 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 THEGQ9P2T0 379 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DPPA5A6NC42 116 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NPIPB8E9PQR5 432 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 STAMBPO95630 424 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FOXM1Q08050 763 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 IRGCQ6NXR0 463 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 OR4N5Q8IXE1 308 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RGMAQ96B86 450 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 NINQ8N4C6 2090 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TRBC2A0A5B9 178 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CSF2P04141 144 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ETFAP13804 333 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ST6GAL1P15907 406 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CRATP43155 626 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ASMTP46597 345 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 IST1P53990 364 aa10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms