RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263665.6

CNTN3-201, Transcript of contactin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTN3, Length 4,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3-201ENST00000263665 ARPC5O15511 151 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SCN2BO60939 215 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SPDEFO95238 335 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 HGFP14210 728 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TNFSF8P32971 234 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ETV4P43268 484 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ALDH3B1P43353 468 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SORDQ00796 357 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF543Q08ER8 600 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 INCA1Q0VD86 236 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CSHL1Q14406 222 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GK3PQ14409 553 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PTPRRQ15256 657 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SPRED1Q7Z699 444 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GPR65Q8IYL9 337 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CARFQ8N187 725 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LIX1Q8N485 282 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF566Q969W8 418 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CMBLQ96DG6 245 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PKP4Q99569 1192 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SRRQ9GZT4 340 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MEGF6O75095 1541 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 A0A0G2JLW4 131 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TNFRSF11BO00300 401 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LRRTM2O43300 516 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 UGDHO60701 494 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMEM63AO94886 807 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 UBXN7O94888 489 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ABLIM3O94929 683 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PRKCGP05129 697 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 COL6A1P12109 1028 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 HTR1EP28566 365 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CPOXP36551 454 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DIO1P49895 249 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TAS2R39P59534 338 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ACTBP60709 375 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RAB10P61026 200 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ACTG1P63261 375 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF460Q14592 562 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 IQCJQ1A5X6 159 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CRY2Q49AN0 593 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 BEST3Q8N1M1 668 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR2L2Q8NH16 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GPR151Q8TDV0 419 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CGRRF1Q99675 332 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CRLF2Q9HC73 371 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SIX2Q9NPC8 291 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 NARFQ9UHQ1 456 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TBX20Q9UMR3 447 aa6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ARVCFO00192 962 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ADAMTS4O75173 837 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TOXO94900 526 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 IL1AP01583 271 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FGF4P08620 206 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ADORA2AP29274 412 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 AVPR1AP37288 418 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 KCNC3Q14003 757 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMC8Q8IU68 726 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR56B4Q8NH76 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RELTQ969Z4 430 aa6.62□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms