RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF3Q13114 568 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS6Q6ZMG9 384 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS48Q7RTY5 328 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM46Q7Z4K8 759 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CALHM3Q86XJ0 350 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 COX14Q96I36 57 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK15Q96Q40 435 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY12Q9H244 342 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP21Q9H596 190 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CLMPQ9H6B4 373 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 IPPKQ9H8X2 491 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKAP23743 735 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDC1P59894 354 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PIANPQ8IYJ0 282 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED5Q9Y3A6 229 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A4O14863 429 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PIAS2O75928 621 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 INMTO95050 263 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL1O95841 491 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PGRP06401 933 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GNPDA1P46926 289 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGDIAP52565 204 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PHACTR4Q8IZ21 702 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ESAMQ96AP7 390 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF6Q96EC8 236 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PYURFQ96I23 114 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC7Q9H6L4 198 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KLQ9UEF7 1012 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAB1Q9Y478 270 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FFAR2O15552 330 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP9O95302 570 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMD1P0DJR0 217 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 AGXTP21549 392 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAM1P38567 509 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA2P43356 314 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL38P63173 70 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LRIF1Q5T3J3 769 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAM1L1Q8N609 369 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL4L1Q8NHW4 92 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SGCDQ92629 289 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC61Q9BV99 259 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPBQ9H078 707 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPS1Q9UHF7 1281 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKBQ9Y6T7 804 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR1BO14657 336 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TEAD1P28347 426 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS4P49798 205 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IST1P53990 364 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNG1Q06432 222 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SBSNQ6UWP8 590 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY8Q86VZ1 359 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAIQ8N9R8 606 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 MCOLN3Q8TDD5 553 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 APOL4Q9BPW4 351 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC90BQ9GZT6 254 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf109Q9NX04 203 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OARD1Q9Y530 152 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A096LPI6 279 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS38A1L453 326 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGES3LE9PB15 166 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA12O60330 932 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1I1O60431 355 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF883P0CG24 379 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ST13P50502 369 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC23LQ6PF05 361 aa25.2■■□□□ 1.62
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