RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 OR2L5Q8NG80 312 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 FAR1Q8WVX9 515 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 WDR34Q96EX3 536 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 CCDC189A1A4V9 331 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 FAM227AF5H4B4 570 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 E2F3O00716 465 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 CLDN4O14493 209 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 PCNAP12004 261 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 EPB42P16452 691 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 TNFRSF8P28908 595 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 MSH2P43246 934 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 SLC26A5P58743 744 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 RCN2Q14257 317 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 ACAP2Q15057 778 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 TBCCQ15814 346 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 INAQ16352 499 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 MEP1AQ16819 746 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 AICDAQ9GZX7 198 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 VPS11Q9H270 941 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 OLAHQ9NV23 265 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 ASB1Q9Y576 335 aa20.41■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF4O60810 478 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 KLHL2O95198 593 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 PFKFB4Q16877 469 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 BEST3Q8N1M1 668 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 TEX9Q8N6V9 391 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 CEP112Q8N8E3 955 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 SERINC2Q96SA4 455 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 OTOGQ6ZRI0 2925 aa20.4■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.39■□□□□ 0.86
NME4-201ENST00000219479 HMX2A2RU54 273 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 PRAMEF2O60811 474 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 EPORP19235 508 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CD22P20273 847 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SERPINB9P50453 376 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 MTTPP55157 894 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 RAB38P57729 211 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SLC13A2Q13183 592 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 MED27Q6P2C8 311 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 FAM47BQ8NA70 645 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 KCNC2Q96PR1 638 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 F2RL3Q96RI0 385 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 PAFAH2Q99487 392 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 A8MUA0 341 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 LRRTM2O43300 516 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 KRT38O76015 456 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 RASAL1O95294 804 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 EDN3P14138 238 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CERS1P27544 350 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SERPINB1P30740 379 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CASP2P42575 452 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 RUNX2Q13950 521 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CHSY3Q70JA7 882 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 HSD17B7P56937 341 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SETDB1Q15047 1291 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ZNF766Q5HY98 468 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 SLC34A3Q8N130 599 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-201ENST00000219479 QRFPRQ96P65 431 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms