RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CASP9P55211 416 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZIC1Q15915 447 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC36A3Q495N2 470 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 COX20Q5RI15 118 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CBLL1Q75N03 491 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SARGQ9BW04 601 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CD320Q9NPF0 282 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZW10O43264 779 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 UQCRC2P22695 453 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 NRROSQ86YC3 692 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNC2Q96PR1 638 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCG4Q9H172 646 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL31Q9H511 634 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0A6YYD5 115 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 BTN3A3O00478 584 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SNAP29O95721 258 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ALBP02768 609 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 LINGO3P0C6S8 592 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 AQP1P29972 269 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CD6P30203 668 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPGP40121 348 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA2P43356 314 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MVDP53602 400 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 IST1P53990 364 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MYBPC3Q14896 1274 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF425Q6IV72 752 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF130Q86XS8 419 aa22.79■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 TPD52L3Q96J77 140 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.79■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 IL1RAPQ9NPH3 570 aa22.79■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.79■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 RNF220Q5VTB9 566 aa22.78■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 C5AR2Q9P296 337 aa22.78■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.78■■□□□ 1.24
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RPUSD1-201ENST00000007264 OR2L5Q8NG80 312 aa22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 AICDAQ9GZX7 198 aa22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.78■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SUV39H1O43463 412 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CLPTM1O96005 669 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 THEGLP0DJG4 465 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT1P36639 197 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.77■■□□□ 1.24
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.77■■□□□ 1.24
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