RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028386.11

Nckap1-201, Transcript of Nck-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nckap1, Length 4,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1-201ENSMUST00000028386 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 NnatQ61979 81 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr17Q7TRM9 315 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fignl1Q8BPY9 683 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Timmdc1Q8BUY5 285 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc41a2Q8BYR8 573 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mrgpra1Q91WW5 304 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Eif2b2Q99LD9 351 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 4931417E11RikQ9CR05 305 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 NtsQ9D3P9 169 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam71e2L7N480 754 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 P01641 117 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ccr7P47774 378 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 CishQ62225 257 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Oog2Q7TPX8 476 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 WtipQ7TQJ8 398 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cts3Q91ZD5 332 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 MmadhcQ99LS1 296 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmigd1Q9D7L8 261 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pate1E9Q658 125 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Anxa3O35639 323 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Syn1O88935 706 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rars2Q3U186 578 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sirt3Q8R104 334 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mettl15Q9DCL4 406 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr605E9Q838 314 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm21319F6YNI8 144 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 St3gal1P54751 337 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Arf5P84084 180 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmem102Q3UPR7 509 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Map4k2Q61161 821 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr699Q7TRN3 316 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 C5ar2Q8BW93 344 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gtpbp3Q923K4 492 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kat8Q9D1P2 458 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp600A2A7V0 737 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 H2-T23P06339 357 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gria2P23819 883 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Entpd1P55772 510 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Psme2P97372 239 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sdc3Q64519 442 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr48Q8VGN4 301 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ist1Q9CX00 362 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 SqorQ9R112 450 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm17190V9GX38 357 aa20.32■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Clcn7O70496 803 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Igfbp5Q07079 271 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr398Q8VFY0 314 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tcte1A6H639 498 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp952B0V2W4 504 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ces2hF6Z9B9 558 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn2r10K7N621 847 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rdh5O55240 318 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Taf1aP97357 453 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr586Q8VH13 317 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Asb8Q91ZT9 288 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cd209eQ91ZW7 208 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 IcmtQ9EQK7 283 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm42372A0A1B0GT27 204 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 CerklA2AQH1 525 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r12G5E8G1 307 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Capn5O08688 640 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pdcd5P56812 126 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Brinp2Q6DFY8 783 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gen1Q8BMI4 908 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Abhd18Q8C1A9 464 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc35e2Q8C811 405 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr352Q8VGJ9 315 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rnf111Q99ML9 989 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Inpp5eQ9JII1 647 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Srp54bE9PXC0 504 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ephb6O08644 1014 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Bcl7cO08664 217 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cpa3P15089 417 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp60P16374 707 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nos3P70313 1202 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nell1Q2VWQ2 810 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Trappc13Q3TIR1 417 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Il10raQ61727 575 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pabpc2Q62029 628 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Smyd4Q8BTK5 799 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Q8C0X8 640 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r205Q8R276 316 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc8b1Q925Q3 585 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gtf2e2Q9D902 292 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slco1c1Q9ERB5 715 aa20.31■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Apex1P28352 317 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tia1P52912 386 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms