RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SOX3P41225 446 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ELP6Q0PNE2 266 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TRIM60Q495X7 471 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MED27Q6P2C8 311 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 UCN3Q969E3 161 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SIAEQ9HAT2 523 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 NUMA1Q14980 2115 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CLCA1A8K7I4 914 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 H3BN98 237 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GASTP01350 101 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 IL3P08700 152 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TIMP2P16035 220 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 HOXD10P28358 340 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CNR2P34972 360 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GGT2P36268 569 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DAB2P98082 770 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CDK6Q00534 326 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 HSPB3Q12988 150 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 IFI44LQ53G44 452 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ELMOD1Q8N336 334 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 YME1L1Q96TA2 773 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 WFDC6Q9BQY6 131 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.95□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TRBC2A0A5B9 178 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PSMD11O00231 422 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GADD45GO95257 159 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GSTM1P09488 218 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MPC1LP0DKB6 136 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 KCNC4Q03721 635 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 NFE2L1Q14494 772 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DEF8Q6ZN54 512 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM203Q969S6 136 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 FOPNLQ96NB1 174 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CLEC2DQ9UHP7 191 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 EYSQ5T1H1 3165 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PCM1Q15154 2024 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF197O14709 1029 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ATG13O75143 517 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CXCL14O95715 111 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 OLFM2O95897 454 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 BCHEP06276 602 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 S100A5P33763 92 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PPP5CP53041 499 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MVDP53602 400 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 KCNJ8Q15842 424 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 DESI1Q6ICB0 168 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PAQR6Q6TCH4 344 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 GULP1Q9UBP9 304 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MYO10Q9HD67 2058 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1W2PRB8 838 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 FEZF1A0PJY2 475 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 WASH3PC4AMC7 463 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SNPHO15079 494 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 KIAA0513O60268 411 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 SLCO2B1O94956 709 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 KCNK2O95069 426 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CDK1P06493 297 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 NPPBP16860 134 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 IL1RNP18510 177 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 VIPR1P32241 457 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 CXCR4P61073 352 aa11.94□□□□□ -0.5
SPIN3-232ENST00000639956 HTRA3P83110 453 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms