RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	B3GALT2	O43825	422 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNA16	P05015	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GSTM2	P28161	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SSR4	P51571	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DR1	Q01658	176 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MGAT5	Q09328	741 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	WWOX	Q9NZC7	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SVIL	O95425	2214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CDC7	O00311	574 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PEX1	O43933	1283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJB6	O75190	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGA10	O75578	1167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFAND5	O76080	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBB4A	P04350	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	RFC3	P40938	356 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PGGT1B	P53609	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB38	P57729	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CDKL1	Q00532	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TERF2	Q15554	542 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	5e-8	■■■■■ 204.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CDKL2	Q92772	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JN53	185 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1B0GTH9	108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HS6ST1	O60243	411 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	WISP2	O76076	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TNNI3	P19429	210 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PTGER1	P34995	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PLA2G16	P53816	162 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HSD17B7	P56937	341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR85	P60893	370 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	STX4	Q12846	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF460	Q14592	562 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NCLN	Q969V3	563 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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