RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAM1Q15629 374 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FTMTQ8N4E7 242 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6N2Q8NGY6 317 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ9Q92806 393 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SGCZQ96LD1 299 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 IL20RAQ9UHF4 553 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GSTM4Q03013 218 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 EXTL2Q9UBQ6 330 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GLUD2P49448 558 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CAP1Q01518 475 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GAD2Q05329 585 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ESAMQ96AP7 390 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PYCR2Q96C36 320 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS10P5Q9NQ39 176 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MATN3O15232 486 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CTBP2P56545 445 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PHOX2BQ99453 314 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF404Q494X3 552 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MTG2Q9H4K7 406 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TREHO43280 583 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 XYLT1Q86Y38 959 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PTGES2Q9H7Z7 377 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2B3O76000 313 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RHOQP17081 205 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF675Q8TD23 568 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HMGB4Q8WW32 186 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMG2Q969U7 264 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 Q9N2J8 555 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NDST2P52849 883 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP5CP53041 499 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TATDN1Q6P1N9 297 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PLD5Q8N7P1 536 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RETREG1Q9H6L5 497 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 LIPKQ5VXJ0 399 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ASF1BQ9NVP2 202 aa18■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TRBC2A0A5B9 178 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ECI2O75521 394 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 AKR1C2P52895 323 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PRR18Q8N4B5 295 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CPXM1Q96SM3 734 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF358Q9NW07 568 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCA6Q8N139 1617 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CD53P19397 219 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MALLQ13021 153 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 C22orf15Q8WYQ4 148 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ST14Q9Y5Y6 855 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 JOSD2Q8TAC2 188 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 EBF2Q9HAK2 575 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GBAP04062 536 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HEXBP07686 556 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 AGTR1P30556 359 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC6A6P31641 620 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NRIP1P48552 1158 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC2A7Q6PXP3 512 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC7A8Q9UHI5 535 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ETV5P41161 510 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 VGLL4Q14135 290 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NAPRTQ6XQN6 538 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DPF1Q92782 380 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DERAQ9Y315 318 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ADRA1BP35368 520 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TLE1Q04724 770 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP2K5Q13163 448 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OTOP2Q7RTS6 562 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4K3Q96R72 315 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC42Q9Y546 428 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MAFO75444 373 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CLCNKBP51801 687 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms