RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 LCN9Q8WX39 176 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MR1Q95460 341 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM237Q96Q45 408 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CD244Q9BZW8 370 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TINAGQ9UJW2 476 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PLAGL1Q9UM63 463 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 K7EPI3 171 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 KLF11O14901 512 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 NPHS1O60500 1241 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CRCPO75575 148 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MLYCDO95822 493 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 EML2O95834 649 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC16A8O95907 504 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 EPB42P16452 691 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 IMPA1P29218 277 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC1A6P48664 564 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PRKAA1Q13131 559 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 NAE1Q13564 534 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 RCN2Q14257 317 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ARMC6Q6NXE6 501 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 KLHL35Q6PF15 583 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB43Q86YS6 212 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 HOMEZQ8IX15 550 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX9Q8N6V9 391 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SMPDL3AQ92484 453 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MIPEPQ99797 713 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMOQ9BU70 441 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC40A1Q9NP59 571 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC11Q9NVH1 559 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 THAP1Q9NVV9 213 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MEMO1Q9Y316 297 aa10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CLGNO14967 610 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TAPBPO15533 448 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNDBP1O95273 360 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHEP01854 428 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 RAF1P04049 648 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 AMD1P17707 334 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 MSX1P28360 303 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PKLRP30613 574 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GGT5P36269 586 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SEPHS1P49903 392 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 AGTR2P50052 363 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNG1P51959 295 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TBPL1P62380 186 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CLCQ05315 142 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 BST1Q10588 318 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2H2Q13888 395 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 UNC50Q53HI1 259 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PPFIBP2Q8ND30 876 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2L8Q8NGY9 312 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF480Q8WV37 535 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ESAMQ96AP7 390 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 IP6K3Q96PC2 410 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 IL17FQ96PD4 163 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GBP5Q96PP8 586 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms