RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABCA1O95477 2261 aa9.66□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLDN4O14493 209 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 HCN1O60741 890 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFS3O75489 264 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 MYO1DO94832 1006 aa9.65□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FMO4P31512 558 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOX3P41225 446 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNASE1L1P49184 302 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 COPS2P61201 443 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIM14Q14142 442 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 P3H1Q32P28 736 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFB134Q4QY38 66 aa9.65□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.65□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SCYL1Q96KG9 808 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 DACH2Q96NX9 599 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 RASL10BQ96S79 203 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHP1Q99653 195 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZFATQ9P243 1243 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.65□□□□□ -0.86
CTDNEP1-202ENST00000570380 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.65□□□□□ -0.86
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ZFAND5O76080 213 aa9.64□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAS8O95995 478 aa9.64□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ALOX12P18054 663 aa9.64□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 AADACL2Q6P093 401 aa9.64□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 WWP2O00308 870 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 WIPF1O43516 503 aa9.63□□□□□ -0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 CEP104O60308 925 aa9.63□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC77Q9BR77 488 aa9.63□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SH3D21A4FU49 640 aa9.62□□□□□ -0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.62□□□□□ -0.87
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