RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 FRG2Q64ET8 278 aa16.49■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-204ENST00000563065 POLHQ9Y253 713 aa16.47■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-204ENST00000563065 B3GALT2O43825 422 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 EEDO75530 441 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAJB5O75953 348 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SASH3O75995 380 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHRNGP07510 517 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 FHP07954 510 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 HMOX2P30519 316 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAP1GDS1P52306 607 aa16.46■□□□□ 0.23
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