RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LZICQ8WZA0 190 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAL2Q969L2 176 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RGMAQ96B86 450 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 F2RL3Q96RI0 385 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOOQ9BUR5 198 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM1AO60341 852 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKLRP30613 574 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RYKP34925 604 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BSGP35613 385 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGFALSP35858 605 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIGAP37287 484 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADPRHP54922 357 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SELENOWP63302 87 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP4F2P78329 520 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNJ10P78508 379 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCARB2Q14108 478 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COX20Q5RI15 118 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUDT13Q86X67 352 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASB12Q8WXK4 309 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPYCQ99645 322 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLNQ9BYT8 704 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLEC1BQ9P126 229 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAAR2Q9P1P5 351 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNK6Q9Y257 313 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCKDKO14874 412 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDUFS4O43181 175 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR1F1O43749 312 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLEC3AO75596 197 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FUCA1P04066 466 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMB5P28074 263 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SOAT1P35610 550 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C7orf34Q96L11 122 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRR19A6NJB7 356 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C9P02748 559 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRHBPP24387 322 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A2P31639 672 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CSNK1G2P78368 415 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM4DQ6B0I6 523 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP68Q76N32 757 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF347Q96SE7 839 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FEZF1A0PJY2 475 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JRKO75564 520 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXB2P14652 356 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSTM2P28161 218 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AQP1P29972 269 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDK6Q00534 326 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.1 ms