RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PPT1	P50897	306 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP15	P51511	669 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCN5	P51795	746 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GSDMD	P57764	484 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CBX1	P83916	185 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	IL10RB	Q08334	325 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT7	Q11130	342 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ST3GAL1	Q11201	340 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	IL18	Q14116	193 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NEDD9	Q14511	834 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP6	Q16828	381 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PMF1	Q6P1K2	205 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KLC3	Q6P597	504 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PACS1	Q6VY07	963 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LUZP1	Q86V48	1076 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM131B	Q86XD5	332 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NRROS	Q86YC3	692 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC1	Q8N766	993 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NECAB1	Q8N987	351 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FCGR1B	Q92637	280 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GGH	Q92820	318 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TAAR8	Q969N4	342 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ITFG2	Q969R8	447 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM46B	Q96A09	425 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX58	Q96C10	678 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM210A	Q96ND0	272 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCD1	Q96NT3	240 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG12	Q9BV10	488 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CUEDC2	Q9H467	287 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTR8	Q9H981	624 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	APMAP	Q9HDC9	416 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP25	Q9NPA2	562 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DONSON	Q9NYP3	566 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MALT1	Q9UDY8	824 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF150	Q9ULK6	438 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0U1RRA0	63 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PN81	502 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	HELT	A6NFD8	242 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MUI8	341 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF879	B4DU55	563 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPB6	O14558	160 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPP2	O43688	288 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CIDEA	O60543	219 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1G1	O75348	118 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6AP2	O75787	350 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSL3	O95573	720 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	YEATS4	O95619	227 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS8	O95995	478 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHE	P01854	428 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT14	P02533	472 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TFPI	P10646	304 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA3	P15088	417 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1C1	P21283	382 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CPN2	P22792	545 aa		2.6	□□□□□ -1.99

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