RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SPATA18Q8TC71 538 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ZNF583Q96ND8 569 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 COQ7Q99807 217 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 PSD2Q9BQI7 771 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DPH5Q9H2P9 285 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 MARCH7Q9H992 704 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 TMOD3Q9NYL9 352 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 TEKT2Q9UIF3 430 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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USP15-218ENST00000552346 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SCN5AQ14524 2016 aa4.67□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 A0A1B0GUV1 79 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 F8WDY8 70 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CHEK1O14757 476 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CHUKO15111 745 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SLC22A2O15244 555 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 AKR7A3O95154 331 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 IFNB1P01574 187 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 MT-ND2P03891 347 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ODC1P11926 461 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ANPEPP15144 967 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 B4GALT1P15291 398 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 FUT1P19526 365 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DCTP40126 519 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DNA2P51530 1060 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 OR1D5P58170 312 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ERVFC1-1P60608 527 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SCGB2A2Q13296 93 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 GPR17Q13304 367 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 GPR50Q13585 617 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 TRIM29Q14134 588 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SPHARQ15513 63 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CEBPEQ15744 281 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CCDC6Q16204 474 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 IRGCQ6NXR0 463 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 PIGZQ86VD9 579 aa4.66□□□□□ -1.66
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USP15-218ENST00000552346 NXPE2Q96DL1 559 aa4.66□□□□□ -1.66
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USP15-218ENST00000552346 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 ANKMY1Q9P2S6 941 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 DOCK7Q96N67 2140 aa4.66□□□□□ -1.66
USP15-218ENST00000552346 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZNF732B4DXR9 585 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 FPGTO14772 594 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 EPHB6O15197 1021 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GMNNO75496 209 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 DIRAS3O95661 229 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 IGHV4-59P01825 116 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GSTA2P09210 222 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CETPP11597 493 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PAX1P15863 534 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 AKT2P31751 481 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 OR1D2P34982 312 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MAGEA4P43358 317 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TNFRSF4P43489 277 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PITPNBP48739 271 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CCR4P51679 360 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ITGA9Q13797 1035 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CEACAM7Q14002 265 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GRB14Q14449 540 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 KRT31Q15323 416 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CES4AQ5XG92 561 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ISCA2Q86U28 154 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.65□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.65□□□□□ -1.67
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