RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CA9Q16790 459 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TCTN1Q2MV58 587 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDONQ4KMG0 1287 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM198Q66K66 360 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NIPAL3Q6P499 406 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ERASQ7Z444 233 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NEK8Q86SG6 692 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GATSQ8NAP1 163 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SMYD1Q8NB12 490 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4A16Q8NH70 328 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UBA3Q8TBC4 463 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 M1APQ8TC57 530 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FANK1Q8TC84 345 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLCO2A1Q92959 643 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LMLNQ96KR4 655 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP19Q96LK0 163 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA33Q96N06 139 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SFXN2Q96NB2 322 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS35Q96QK1 796 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB40CQ96S21 281 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MMS19Q96T76 1030 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CPNE1Q99829 537 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NUF2Q9BZD4 464 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 WWP1Q9H0M0 922 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OSER1Q9NX31 292 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IFNKQ9P0W0 207 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.36□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PEG3Q9GZU2 1588 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A087X0K7 114 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0U1RRA0 63 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PRB8 838 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PLSCR5A0PG75 271 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2AG2A6NM03 316 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5K4A6NMS3 321 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 B5MCH6 92 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 H0YGN5 161 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PDXKO00764 312 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BCKDKO14874 412 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DUX1O43812 170 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PMPCBO75439 489 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT7P08729 469 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AKR1A1P14550 325 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNB1P14635 433 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GNSP15586 552 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGB6P18564 788 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TNNI1P19237 187 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGAXP20702 1163 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HNF1AP20823 631 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LCN1P31025 176 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PRKAR2BP31323 418 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PCK1P35558 622 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PTGFRP43088 359 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC7A2P52569 658 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PRPS1P60891 318 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMC5P62195 406 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RHAGQ02094 409 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CNTN2Q02246 1040 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms