RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 BCHEP06276 602 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 LINGO3P0C6S8 592 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CASP9P55211 416 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ACTA2P62736 377 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 ACTG2P63267 376 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 OGDHQ02218 1023 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 GRM7Q14831 915 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 CERS4Q9HA82 394 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 LCTLQ6UWM7 567 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 SERINC2Q96SA4 455 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 DRGXA6NNA5 263 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM135Q86UB9 458 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 U3KQV3 271 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PRQ8 180 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 FABP12A6NFH5 140 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC15A1P46059 708 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A9P82251 487 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 EFR3AQ14156 821 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 NETO2Q8NC67 525 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RARRES3Q9UL19 164 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JNG1 304 aa8.19□□□□□ -1.1
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