RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PCDH7O60245 1069 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 OR2B3O76000 313 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SCELO95171 688 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MT-CO3P00414 261 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ALOX12P18054 663 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ITIH1P19827 911 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ITGAXP20702 1163 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GPX3P22352 226 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 IL12AP29459 219 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SSR2P43308 183 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RAP1GDS1P52306 607 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 BTN3A2P78410 334 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FOXM1Q08050 763 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DEFB134Q4QY38 66 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SPIN4Q56A73 249 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TREML1Q86YW5 311 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 UCN3Q969E3 161 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RGMAQ96B86 450 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TMEM74Q96NL1 305 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TSSK3Q96PN8 268 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KCNC2Q96PR1 638 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ASIC5Q9NY37 505 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HYKKA2RU49 373 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SGK494L7N484 410 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF749O43361 778 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RDH16O75452 317 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 LRATO95237 230 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KCNK5O95279 499 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FGF5P12034 268 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CEACAM1P13688 526 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ACPPP15309 386 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF28P17035 718 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ITGA1P56199 1179 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 UFM1P61960 85 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MC1RQ01726 317 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ACY1Q03154 408 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RUNX2Q13950 521 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GRM7Q14831 915 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SMU1Q2TAY7 513 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TCTE1Q5JU00 501 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MANEAQ5SRI9 462 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PAOXQ6QHF9 649 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NUDT13Q86X67 352 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FITM2Q8N6M3 262 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ERP27Q96DN0 273 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CSF3RQ99062 836 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.72□□□□□ -1.17
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