RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RTL4Q6ZR62 310 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FAM47EQ6ZV65 393 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ASPGQ86U10 573 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MEIOBQ8N635 442 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 OR6P1Q8NGX9 317 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ACTL9Q8TC94 416 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 NCLNQ969V3 563 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 THAP11Q96EK4 314 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 VMP1Q96GC9 406 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MARK4Q96L34 752 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PANX3Q96QZ0 392 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PIGQQ9BRB3 760 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HEMGNQ9BXL5 484 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 EXO5Q9H790 373 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PROK2Q9HC23 129 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CHMP5Q9NZZ3 219 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZFATQ9P243 1243 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 GALPQ9UBC7 116 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ABCA1O95477 2261 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 NCKAP5O14513 1909 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 LRRC3CA6NJW4 275 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 TGFBR3LH3BV60 316 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 WWP2O00308 870 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZFAND5O76080 213 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 IL18BPO95998 194 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ATP5DP30049 168 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PIGAP37287 484 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FOXF2Q12947 444 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 KCNJ11Q14654 390 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 TERF2Q15554 542 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SLC18A3Q16572 532 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 DEFB134Q4QY38 66 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 BIRC8Q96P09 236 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SH2D2AQ9NP31 389 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SACM1LQ9NTJ5 587 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 DSCAMO60469 2012 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CR1P17927 2039 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CASKO14936 926 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 KPNA5O15131 536 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RBP3P10745 1247 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 26.3
CS-208ENST00000547298 IMPA1P29218 277 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 OPRM1P35372 400 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HSD17B2P37059 387 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 TRPC1P48995 793 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HK2P52789 917 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HERC3Q15034 1050 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 RPS6KA1Q15418 735 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PARP6Q2NL67 630 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 OR52K1Q8NGK4 314 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 TIMP4Q99727 224 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ANO10Q9NW15 660 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CD8B2A6NJW9 211 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 PSTPIP1O43586 416 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 NIPSNAP2O75323 286 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ALOX12P18054 663 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 HRH2P25021 359 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 CTNNA2P26232 953 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 ZBED6P86452 979 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-208ENST00000547298 DUSP8Q13202 625 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms