RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539498.1

RAN-209, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAN, Length 1,659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-209	ENST00000539498	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MATN3	O15232	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KRT19	P08727	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CYP2A7	P20853	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DGKA	P23743	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MARK3	P27448	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PIK3R1	P27986	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GAMT	Q14353	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MAPK11	Q15759	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UGP2	Q16851	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CCL24	O00175	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LDB3	O75112	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RFPL2	O75678	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SERPING1	P05155	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LGALS2	P05162	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	HOXB2	P14652	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	IER3	P46695	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	AMT	P48728	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ENTPD1	P49961	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KCNJ10	P78508	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GALK2	Q01415	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TRAF3	Q13114	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CEBPE	Q15744	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SPRY3	O43610	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NEMF	O60524	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CLDN14	O95500	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PRF1	P14222	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	AREG	P15514	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SCP2	P22307	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ACP1	P24666	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CDC25A	P30304	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CHRNA3	P32297	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ARFIP1	P53367	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GMFB	P60983	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	IL17A	Q16552	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CALCRL	Q16602	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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