RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533495.5

RRM1-213, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 2

Gene RRM1, Length 2,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-213	ENST00000533495	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SCAMP1	O15126	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ACADM	P11310	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ZNF30	P17039	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PSMC3	P17980	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MSH3	P20585	1137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	HNF1A	P20823	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ABCB4	P21439	1286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	AGXT	P21549	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GAL	P22466	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ITGA1	P56199	1179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	CA9	Q16790	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MIER2	Q8N344	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	COL1A2	P08123	1366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495		A0A087X0M5	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495		A0A1B0GX30	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495		M0QYV0	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SLC30A4	O14863	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	AKR7A2	O43488	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	AVIL	O75366	819 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	UBXN7	O94888	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	C22orf31	O95567	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TGM6	O95932	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GSR	P00390	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OPN1LW	P04000	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	UGT2B4	P06133	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ADRB1	P08588	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	LAG3	P18627	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ZP3	P21754	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	GNPDA1	P46926	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OMP	P47874	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SUOX	P51687	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	METAP1	P53582	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	ASIC1	P78348	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TCF15	Q12870	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	RAB39A	Q14964	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRM1-213	ENST00000533495	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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