RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 NEIL2Q969S2 332 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF558Q96NG5 402 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 RDH12Q96NR8 316 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 COQ7Q99807 217 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 DOHHQ9BU89 302 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 PDFQ9HBH1 243 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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RNPC3-208ENST00000533099 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.9□□□□□ -1.14
RNPC3-208ENST00000533099 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.9□□□□□ -1.14
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RNPC3-208ENST00000533099 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 AP3D1O14617 1153 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 OR1F1O43749 312 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 UPK1BO75841 260 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 ITGA2P17301 1181 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 PPP2R1BP30154 601 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 SLC35A2P78381 396 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 QPRTQ15274 297 aa7.9□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.9□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 OR7G3Q8NG95 312 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.9□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 PKMYT1Q99640 499 aa7.9□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 XKR8Q9H6D3 395 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF222Q9UK12 451 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.9□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 M0R3H8 397 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 ARID1AO14497 2285 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 LRRTM2O43300 516 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 GABARAPO95166 117 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 C8AP07357 584 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 NR2F6P10588 404 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 CYBAP13498 195 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 ACVR1Q04771 509 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 MPPE1Q53F39 396 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 F2RL3Q96RI0 385 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 MROQ9BYG7 248 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 RNF208Q9H0X6 261 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 SP140LQ9H930 580 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 CLCA1A8K7I4 914 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 H7BY64 318 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 AREL1O15033 823 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 OLR1P78380 273 aa7.89□□□□□ -1.15
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RNPC3-208ENST00000533099 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 PROX2Q3B8N5 592 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 CST9Q5W186 159 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 IQCHQ86VS3 1027 aa7.89□□□□□ -1.15
RNPC3-208ENST00000533099 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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