RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MSH2P43246 934 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PSMC4P43686 418 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MARCKSL1P49006 195 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PRELPP51888 382 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CCNG1P51959 295 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CAV1Q03135 178 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 BNIP1Q12981 228 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RAPSNQ13702 412 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PTK6Q13882 451 aa4.07□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 TTC27Q6P3X3 843 aa4.07□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CEP97Q8IW35 865 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CERS5Q8N5B7 392 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SHC3Q92529 594 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 KRT35Q92764 455 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MYADMQ96S97 322 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 AGPAT1Q99943 283 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IDI2Q9BXS1 227 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 THAP2Q9H0W7 228 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CENPHQ9H3R5 247 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 BATF3Q9NR55 127 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 EURLQ9NYK6 297 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 POLLQ9UGP5 575 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SNX24Q9Y343 169 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ALG6Q9Y672 507 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MYH10P35580 1976 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MYH4Q9Y623 1939 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 A8MU10 97 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RASGRF2O14827 1237 aa4.06□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 NDUFB10O96000 172 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SPARCP09486 303 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 KRT13P13646 458 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TNFAIP3P21580 790 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 UGT1A4P22310 534 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IVDP26440 423 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PTGER3P43115 390 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MAPK9P45984 424 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 GPR143P51810 404 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SLC18A1P54219 525 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PLTPP55058 493 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PRKAA1Q13131 559 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RASA2Q15283 850 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TAF13Q15543 124 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CGB2Q6NT52 195 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ASRGL1Q7L266 308 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SPATA21Q7Z572 469 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 DAW1Q8N136 415 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ESX1Q8N693 406 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 OMA1Q96E52 524 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IFT74Q96LB3 600 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TIPINQ9BVW5 301 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TMEM206Q9H813 350 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MTUS1Q9ULD2 1270 aa4.06□□□□□ -1.76
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