RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521948.1

UQCRB-208, Transcript of ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein, human

TSL 2

Gene UQCRB, Length 997 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UQCRB-208	ENST00000521948	SURF4	O15260	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ACSL3	O95573	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CD22	P20273	847 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	PCGF2	P35227	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ETV5	P41161	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	DCDC1	P59894	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	COL4A1	P02462	1669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948		A0A1W2PPK0	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948		G3V2L1	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ADAM20	O43506	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SNX3	O60493	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SNAP91	O60641	907 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CSN3	P07498	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	EPCAM	P16422	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CLCN4	P51793	760 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ITPK1	Q13572	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	5e-12	■□□□□ 8.5
UQCRB-208	ENST00000521948	OPCML	Q14982	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	PSMB7	Q99436	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	FEV	Q99581	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CPNE1	Q99829	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	AADAC	P22760	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CDC25C	P30307	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	NNMT	P40261	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CCR3	P51677	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	GPC2	Q8N158	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UQCRB-208	ENST00000521948	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	SLC1A7	O00341	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	GFPT2	O94808	682 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	STARD3NL	O95772	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	IGHD	P01880	384 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	CETN2	P41208	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	CLDN15	P56746	228 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UQCRB-208	ENST00000521948	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms