RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACY1	Q03154	408 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		A8MU10	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MELTF	P08582	738 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SOAT1	P35610	550 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ROR1	Q01973	937 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAPK11	Q15759	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF749	O43361	778 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	LRCH4	O75427	683 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CD1D	P15813	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	AZU1	P20160	251 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75	4e-9	■■■■□ 24.7
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSPY1	Q01534	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ABR	Q12979	859 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PHOX2A	O14813	284 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TXNL1	O43396	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCO2	O43819	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GRAP2	O75791	330 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MT-ND1	P03886	318 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	GLUL	P15104	373 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPBWR1	P48145	328 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	KHK	P50053	298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BTG1	P62324	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MCM10	Q7L590	875 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RIT1	Q92963	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A0B4J203	849 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1B0GTH9	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	KLLN	B2CW77	178 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PSMB4	P28070	264 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	PTEN	P60484	403 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBP5	P82980	135 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	BFSP1	Q12934	665 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SCARB2	Q14108	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NCKAP1-208	ENST00000495619	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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