RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 GRAP2O75791 330 aa4.77□□□□□ -1.65
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USP34-216ENST00000487547 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP34-216ENST00000487547 FGFRL1Q8N441 504 aa4.73□□□□□ -1.65
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USP34-216ENST00000487547 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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