RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SH3GL2Q99962 352 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RHOJQ9H4E5 214 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ARL15Q9NXU5 204 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TINAGQ9UJW2 476 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC16A5O15375 505 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CHST10O43529 356 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 B4GALT2O60909 372 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CYC1P08574 325 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GRK3P35626 688 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HNF4AP41235 474 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB9P50453 376 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CCR8P51685 355 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR4D2P58180 307 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC26A5P58743 744 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 IL2P60568 153 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 BTG2P78543 158 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 BMPR2Q13873 1038 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR1C1Q15619 314 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 C3AR1Q16581 482 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CROCCP2Q86T23 111 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MZB1Q8WU39 189 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NEIL2Q969S2 332 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ARL8AQ96BM9 186 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 VPS39Q96JC1 886 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MMP25Q9NPA2 562 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TBK1Q9UHD2 729 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.86□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TRBC2A0A5B9 178 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GABRR3A8MPY1 467 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 C4orf51C9J302 202 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC19A2O60779 497 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KRT38O76015 456 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FHP07954 510 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MYZAPP0CAP1 466 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ALOX12P18054 663 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2ADP20671 130 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CCND1P24385 295 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RAB8AP61006 207 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HERC3Q15034 1050 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CDSNQ15517 529 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 EXT1Q16394 746 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MEP1AQ16819 746 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FBXL8Q96CD0 374 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PGM2Q96G03 612 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SCMH1Q96GD3 660 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR1F2PQ96R84 312 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LPAR4Q99677 370 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GPR22Q99680 433 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HAUS8Q9BT25 410 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AICDAQ9GZX7 198 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RHBGQ9H310 441 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KLHL31Q9H511 634 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TACC2O95359 2948 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GTF3C1Q12789 2109 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 A8MUA0 341 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CDC7O00311 574 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NEURL1O76050 574 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms