RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 IL5RAQ01344 420 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 HYAL1Q12794 435 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PDE7AQ13946 482 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 VEZF1Q14119 521 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CYP2A13Q16696 494 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF691Q5VV52 312 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 XAF1Q6GPH4 301 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF773Q6PK81 442 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RDH12Q96NR8 316 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MYNNQ9NPC7 610 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 BAG5Q9UL15 447 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 BCKDKO14874 412 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KMOO15229 486 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF21O75509 655 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SERPIND1P05546 499 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FMO3P31513 532 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CCR3P51677 355 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RPA4Q13156 261 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CLCA4Q14CN2 919 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ADCK2Q7Z695 626 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KRT78Q8N1N4 520 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 OXR1Q8N573 874 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SMYD1Q8NB12 490 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 OR52J3Q8NH60 311 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CD93Q9NPY3 652 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 LHX9Q9NQ69 397 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 F5P12259 2224 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PQU0 124 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 H3BMQ9 156 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 M0QX08 132 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLC31A1O15431 190 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 OR1F1O43749 312 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MAN1A2O60476 641 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TFPTP0C1Z6 253 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ERGP11308 486 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 LAMP2P13473 410 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CD247P20963 164 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 C5AR1P21730 350 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 NR4A1P22736 598 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RRM2P31350 389 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PTGER1P34995 402 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PCGF2P35227 344 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TRIM23P36406 574 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 GSSP48637 474 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RAD23AP54725 363 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CDK5R2Q13319 367 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SCARB2Q14108 478 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FAM124AQ86V42 546 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SPARTQ8N0X7 666 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TAMM41Q96BW9 452 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 COG8Q96MW5 612 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 DOHHQ9BU89 302 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 LHPPQ9H008 270 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RUBCNLQ9H714 662 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.48□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPW3 197 aa8.47□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 J3KTA2 159 aa8.47□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLC1A7O00341 560 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms