RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	UHRF2	Q96PU4	802 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM17-208	ENST00000467080	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PP11	408 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	UBE2C	O00762	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KRT86	O43790	486 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MED24	O75448	989 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	LYPLA2	O95372	231 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SP1	P08047	785 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KCNE1	P15382	129 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GABRB1	P18505	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GABRG2	P18507	467 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SAT1	P21673	171 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HSPA4	P34932	840 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TERF1	P54274	439 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PHEX	P78562	749 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SEMG2	Q02383	582 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	BFSP1	Q12934	665 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KRT81	Q14533	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GLRX5	Q86SX6	157 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SCML4	Q8N228	414 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	LINGO1	Q96FE5	620 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SEMA3C	Q99985	751 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CENPE	Q02224	2701 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CACNA1D	Q01668	2161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CTAGE9	A4FU28	777 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	OR5K3	A6NET4	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GLOD5	A6NK44	160 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DVL1	O14640	695 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ADAM20	O43506	726 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HCRT	O43612	131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CTAGE8	P0CG41	777 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CXCL8	P10145	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	VDR	P11473	427 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM11	P17152	192 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	IFNAR1	P17181	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ACADL	P28330	430 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CDC25C	P30307	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	TNFSF9	P41273	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	IFNAR2	P48551	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	PDGFRL	Q15198	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC190	Q86UF4	302 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	EMC1	Q8N766	993 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	POC5	Q8NA72	575 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	KCTD6	Q8NC69	237 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	APPL2	Q8NEU8	664 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	WBP2	Q969T9	261 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	ALG14	Q96F25	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	HES6	Q96HZ4	224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	FAM20A	Q96MK3	541 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM17-208	ENST00000467080	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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