RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGEA12P43365 314 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 ATCAYQ86WG3 371 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 IQCKQ8N0W5 287 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.46■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.45■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.44■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.44■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2H2Q13888 395 aa22.43■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.43■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 OR7G3Q8NG95 312 aa22.43■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 NPAS2Q99743 824 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 OR51B5Q9H339 312 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.43■■□□□ 1.18
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