RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LANCL2Q9NS86 450 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MKS1Q9NXB0 559 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 G3V2L1 256 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GALT2O43825 422 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJB5O75953 348 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SUPT7LO94864 414 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HPP00738 406 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TGFB1P01137 390 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FHP07954 510 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 JAK1P23458 1154 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G16P53816 162 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MTTPP55157 894 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH13P55290 713 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PHEXP78562 749 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CHAF1BQ13112 559 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAF3Q13114 568 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SHISA5Q8N114 240 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CA13Q8N1Q1 262 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM237Q96Q45 408 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MLYCDO95822 493 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MYL2P10916 166 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 EFNA3P52797 238 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJB13P59910 316 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OLR1P78380 273 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RHAGQ02094 409 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CUL3Q13618 768 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RUNX2Q13950 521 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CROCCP2Q86T23 111 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT16Q8N428 558 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 BANPQ8N9N5 519 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK15Q96Q40 435 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPKQ9BS16 269 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MID2Q9UJV3 735 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PLLPQ9Y342 182 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PCSK5Q92824 1860 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SCELO95171 688 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 COX6A1P12074 109 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ICAM2P13598 275 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CPA3P15088 417 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF844Q08AG5 666 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RCN2Q14257 317 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MYBPC3Q14896 1274 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 FRG2Q64ET8 278 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 HPS6Q86YV9 775 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF843Q8N446 348 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 RGMAQ96B86 450 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf44Q96CB5 159 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 FRG2BQ96QU4 278 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF382Q96SR6 550 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51B5Q9H339 312 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 LYRM4Q9HD34 91 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR83Q9NYM4 423 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 SENP1Q9P0U3 644 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 C5AR2Q9P296 337 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 DAPP1Q9UN19 280 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JN53 185 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms