RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 TAC4Q86UU9 113 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DTLQ9NZJ0 730 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ENTPD1P49961 510 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KCTD9Q7L273 389 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ARL14Q8N4G2 192 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR5K4A6NMS3 321 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 M0R2N6 131 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PMM2O15305 246 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RAC2P15153 192 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 AOC1P19801 751 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 EMX2Q04743 252 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LIPJQ5W064 366 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF773Q6PK81 442 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR52B2Q96RD2 323 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF649Q9BS31 505 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 WACQ9BTA9 647 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DERL2Q9GZP9 239 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 VNN3Q9NY84 501 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ALDH3B2P48448 385 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PSPHP78330 225 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR2T33Q8NG76 320 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FANK1Q8TC84 345 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TRIB3Q96RU7 358 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 H0YAE9 185 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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USP46-201ENST00000441222 EPOP01588 193 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 IFI30P13284 250 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCNOP22674 350 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SHMT2P34897 504 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MZT1Q08AG7 82 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPA4Q13156 261 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FADDQ13158 208 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SERINC3Q13530 473 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.46□□□□□ -1.38
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