RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 BTAF1O14981 1849 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 A0A1W2PQ72 361 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RPP14O95059 124 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 S1PR4O95977 384 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 SLC6A4P31645 630 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CDK3Q00526 305 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DLG1Q12959 904 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 BNIP1Q12981 228 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 LIPJQ5W064 366 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TRBC2A0A5B9 178 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DGKQP52824 942 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ZNF33BQ06732 778 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RNF130Q86XS8 419 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CNTD1Q8N815 330 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NUP43Q8NFH3 380 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR8K5Q8NH50 307 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OXSMQ9NWU1 459 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CCL26Q9Y258 94 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 IL3P08700 152 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ENTPD1P49961 510 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CACNA2D1P54289 1103 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CDK6Q00534 326 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 SMCO1Q147U7 214 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 PNCKQ6P2M8 343 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TMEM107Q6UX40 140 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ZNF550Q7Z398 422 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 MOAP1Q96BY2 351 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ROPN1LQ96C74 230 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 KCNK12Q9HB15 430 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 HHATLQ9HCP6 504 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 BATF3Q9NR55 127 aa11.64□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 C1orf226A1L170 272 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 UNC5CO95185 931 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 C9P02748 559 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 GALNT10Q86SR1 603 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RAB8BQ92930 207 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 FAM149AA5PLN7 773 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 A6NLC8 198 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 HOXC13P31276 330 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CCL11P51671 97 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 MERTKQ12866 999 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NFATC4Q14934 902 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DPPA4Q7L190 304 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 MEIOBQ8N635 442 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OARD1Q9Y530 152 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CORO7P57737 925 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TEX19Q8NA77 164 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 SFXN2Q96NB2 322 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 H3BSH0 61 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 MPZL2O60487 215 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 RCBTB2O95199 551 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 TAB1Q15750 504 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEK1-201ENST00000439128 REEP4Q9H6H4 257 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms