RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKP3Q9Y446 797 aa4.3□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.3□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC16AO15027 2179 aa4.3□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SVILO95425 2214 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51F1A6NGY5 319 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 STMND1H3BQB6 276 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0R3H8 397 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CES2O00748 559 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A9O60656 530 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK14O94921 469 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNB1P01574 187 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIFP15018 202 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREB1P16220 341 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A6P19224 532 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-DPA1P20036 260 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A1P22309 533 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A4P22310 534 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD1CP29017 333 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A3P35503 534 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPZBP47756 277 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FASLGP48023 281 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR2C2P49116 596 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCNKAP51800 687 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIMK2P53671 638 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GEMP55040 296 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HADHBP55084 474 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCNP55089 124 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RWDD2BP57060 319 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXM1Q08050 763 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 XRCC4Q13426 336 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX1Q13596 522 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR1D2Q14995 579 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD16Q32M84 506 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF843Q8N446 348 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBL4BQ8N7F7 174 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A6Q92581 669 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TADA1Q96BN2 335 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA13Q96N96 652 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC25Q96NG3 672 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRTNQ99748 197 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HGH1Q9BTY7 390 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWP1Q9H0M0 922 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL26Q9NPH9 171 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 OGFRQ9NZT2 677 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.29□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLNCQ14315 2725 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0G2JNG1 304 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa4.28□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms