RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 ZNF33BQ06732 778 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CHIT1Q13231 466 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 KRT78Q8N1N4 520 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CCT6BQ92526 530 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ISL2Q96A47 359 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 FMO2Q99518 471 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RNF32Q9H0A6 362 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RHBGQ9H310 441 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 MMP25Q9NPA2 562 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF358Q9NW07 568 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ACOT9Q9Y305 439 aa14.52□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 A0A087X1B8 175 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 A0A096LPK6 155 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 DYTNA2CJ06 578 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 BLACEA4D250 179 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CERS1P27544 350 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CASP2P42575 452 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PLA2G16P53816 162 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SKP1P63208 163 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PCDH1Q08174 1060 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 TBCCQ15814 346 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 EXT1Q16394 746 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 FHL5Q5TD97 284 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 BEST3Q8N1M1 668 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RNF175Q8N4F7 328 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 OR2L5Q8NG80 312 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 M1APQ8TC57 530 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ELP5Q8TE02 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 FAR1Q8WVX9 515 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 IFT81Q8WYA0 676 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 CSF3RQ99062 836 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 LPAR4Q99677 370 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 OR5H15A6NDH6 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 A8MUI8 341 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 K7EPI3 171 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 KLK8O60259 260 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PRMT3O60678 531 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 KLHL2O95198 593 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PPP2R1BP30154 601 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PHBP35232 272 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SERPINB8P50452 374 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 RAB38P57729 211 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 AP2B1P63010 937 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 IRF8Q02556 426 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 SETDB1Q15047 1291 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ACER2Q5QJU3 275 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 LAS2Q8IYD9 372 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 FAM47BQ8NA70 645 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 MNS1Q8NEH6 495 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PRR7Q8TB68 274 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 F2RL3Q96RI0 385 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PAFAH2Q99487 392 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 MS4A8Q9BY19 250 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 KCNK13Q9HB14 408 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.5□□□□□ -0.09
SPC24-201ENST00000423327 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms