RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMD9O00233 223 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 IFI30P13284 250 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP3K8P41279 467 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3BP2P78314 561 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RDH12Q96NR8 316 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CD47Q08722 323 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 FADDQ13158 208 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ASPGQ86U10 573 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 BOCQ9BWV1 1114 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 IFT46Q9NQC8 304 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSL1P33121 698 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM8P78325 824 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF773Q6PK81 442 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2L5Q8NG80 312 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN14A8MX76 684 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CYB5AP00167 134 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 EDNRAP25101 427 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HSF2Q03933 536 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RBBP4Q09028 425 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RUNX3Q13761 415 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SGCBQ16585 318 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCB7O75027 752 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SRCP12931 536 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNC1P48547 511 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SUOXP51687 545 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 BBS10Q8TAM1 723 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TAMM41Q96BW9 452 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTT2BP0CG30 244 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KDELR2P33947 212 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 INAVAQ3KP66 663 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOCQ15369 112 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CHST14Q8NCH0 376 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HAVCR1Q96D42 359 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 BRD7Q9NPI1 651 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 FESP07332 822 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 OR12D1P0DN82 309 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNAB2Q13303 367 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM156Q8N614 296 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 F2RL3Q96RI0 385 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 UPB1Q9UBR1 384 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PCTPQ9UKL6 214 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF10O60809 474 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-DPB1P04440 258 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPK14Q16539 360 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KANK2Q63ZY3 851 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf40Q86WS4 652 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CARM1Q86X55 608 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 DPH7Q9BTV6 452 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 OR12D2P58182 307 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 DOHHQ9BU89 302 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL33A6NCF5 533 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF879B4DU55 563 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms