RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT2B10P36537 528 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CRISP3P54108 245 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 HBA1P69905 142 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TEAD4Q15561 434 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 USP43Q70EL4 1123 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF605Q86T29 641 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 STX19Q8N4C7 294 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 POC5Q8NA72 575 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 OR9Q2Q8NGE9 314 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKMY1Q9P2S6 941 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSL6Q9UKU0 697 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCR3O14972 297 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN6O43657 245 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO2B1O94956 709 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF33BQ06732 778 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNC3Q14003 757 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 STEAP3Q658P3 488 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF226Q9NYT6 803 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A14Q9UN76 642 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PTHP01270 115 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MESP2Q0VG99 397 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 NFKBIDQ8NI38 313 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CHTF18Q8WVB6 975 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM159Q96B96 161 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP44Q9C0F1 390 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 BRF2Q9HAW0 419 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R16Q9NYV7 291 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A13Q9UJS0 675 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SPEGQ15772 3267 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SAP18O00422 153 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 DLGAP3O95886 979 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ADORA3P0DMS8 318 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MVDP53602 400 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSCP53634 463 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ST3GAL4Q11206 333 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI44LQ53G44 452 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 GDPD4Q6W3E5 623 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS11BQ86T26 416 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 COQ8BQ96D53 544 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35A5Q9BS91 424 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 COQ9O75208 318 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf47O95873 294 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 IMPA1P29218 277 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 VIPR2P41587 438 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MC1RQ01726 317 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 AMER2Q8N7J2 671 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AK3PQ8NH89 298 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PKP4Q99569 1192 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CCM2Q9BSQ5 444 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPOQ9BU64 300 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CDADC1Q9BWV3 514 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 IMPAD1Q9NX62 359 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP12Q9UNI6 340 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 POFUT2Q9Y2G5 429 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD3B1P14060 373 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD3B2P26439 372 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PRIM2P49643 509 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A9P82251 487 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SELENBP1Q13228 472 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SCARB2Q14108 478 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MICAQ29983 383 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SPIN4Q56A73 249 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LY6G5CQ5SRR4 150 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LACC1Q8IV20 430 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RASGRP3Q8IV61 690 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4C15Q8NGM1 316 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ATL1Q8WXF7 558 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 NEIL2Q969S2 332 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms