RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 HCRTO43612 131 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA1P01562 189 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJB1P25685 340 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GRIA2P42262 883 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FNTBP49356 437 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CLCN2P51788 898 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF8P60827 252 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC3A1Q07837 685 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT2Q10471 571 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PMS2P3Q13401 168 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GRB7Q14451 532 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SEC23BQ15437 767 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GPR33Q49SQ1 333 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OSTM1Q86WC4 334 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TDP1Q9NUW8 608 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RFPL2O75678 378 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR2B3O76000 313 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EOMESO95936 686 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BCKDHAP12694 445 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LHCGRP22888 699 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BMXP51813 675 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 WNT7BP56706 349 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ADAM15Q13444 863 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.045e-7■■■■□ 20
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6AP1Q15904 470 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL15Q96M94 604 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BRD7Q9NPI1 651 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H0YAE9 185 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PSMD9O00233 223 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PIRO00625 290 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DLGAP1O14490 977 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TOXO94900 526 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CKMT1AP12532 417 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CDK6Q00534 326 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CRHR2Q13324 411 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FRG2Q64ET8 278 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRM-202ENST00000400053 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BORCS8Q96FH0 119 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FRG2BQ96QU4 278 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PEX12O00623 359 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RASAL1O95294 804 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 F2P00734 622 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 F8A1P23610 371 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CCL23P55773 120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NCS1P62166 190 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLD4Q96BZ4 506 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NELFAQ9H3P2 528 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 Q9Y3F1 56 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CMAHPQ9Y471 501 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 COL18A1P39060 1754 aa8.57□□□□□ -1.04
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