RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390484.1

TRAJ54-201, Transcript of T cell receptor alpha joining 54, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAJ54, Length 60 nt, Biotype TR J gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAJ54-201ENST00000390484 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GNMTQ14749 295 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MVPQ14764 893 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CASP8Q14790 479 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MEF2DQ14814 521 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLMAPQ14BN4 828 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TMEM132DQ14C87 1099 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 HEPACAMQ14CZ8 416 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PSMD6Q15008 389 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 HERPUD1Q15011 391 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ABRAXAS2Q15018 415 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TNIP1Q15025 636 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC39A14Q15043 492 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MLC1Q15049 377 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ARHGEF6Q15052 776 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 POSTNQ15063 836 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PON2Q15165 354 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PON3Q15166 354 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PSG5Q15238 335 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RASA2Q15283 850 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 IRF4Q15306 451 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RALBP1Q15311 655 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KRT31Q15323 416 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RPS6KA2Q15349 733 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DLGAP5Q15398 846 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 RGNQ15493 299 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SPHARQ15513 63 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TAF11Q15544 211 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 OR1C1Q15619 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TRIP10Q15642 601 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TPSAB1Q15661 275 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PTPN14Q15678 1187 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF174Q15697 407 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CD226Q15762 336 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MPPED2Q15777 294 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 NPTX1Q15818 432 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 STK11Q15831 433 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF79Q15937 498 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF726P1Q15940 193 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CNGA3Q16281 694 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC15A2Q16348 729 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ASIC2Q16515 512 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PPP2R5EQ16537 467 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ACKR1Q16570 336 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SGCAQ16586 387 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TAF9Q16594 264 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CALCRLQ16602 461 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 AANATQ16613 207 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MEA1Q16626 185 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 POU2AF1Q16633 256 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PTGISQ16647 500 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PRSS8Q16651 343 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GUCA2BQ16661 112 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DUSP5Q16690 384 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KYNUQ16719 465 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 GUK1Q16774 197 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 MEP1AQ16819 746 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PTPROQ16827 1216 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DUSP7Q16829 419 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 UGP2Q16851 508 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PFKFB4Q16877 469 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 C4orf26Q17RF5 130 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TIGD6Q17RP2 521 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ECSCRQ19T08 205 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC5A12Q1EHB4 618 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DUOXA1Q1HG43 343 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 INSCQ1MX18 579 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LRRC36Q1X8D7 754 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 KIAA0753Q2KHM9 967 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CCDC96Q2M329 555 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ABCB5Q2M3G0 1257 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SLC35G1Q2M3R5 365 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF181Q2M3W8 571 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 ZNF674Q2M3X9 581 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 TMEM44Q2T9K0 475 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 CCDC57Q2TAC2 916 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 WSCD2Q2TBF2 565 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 AP5B1Q2VPB7 878 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 PRTGQ2VWP7 1150 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 DEFB116Q30KQ4 102 aa-0.08□□□□□ -2.42
TRAJ54-201ENST00000390484 BTBD16Q32M84 506 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms