RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 DOK6Q6PKX4 331 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LBX2Q6XYB7 198 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 COMMD7Q86VX2 200 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LAX1Q8IWV1 398 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 OTULINQ96BN8 352 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NXPE2Q96DL1 559 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CDCA5Q96FF9 252 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C7orf34Q96L11 122 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 OPALINQ96PE5 141 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CDK15Q96Q40 435 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FEVQ99581 238 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GPR21Q99679 349 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CD244Q9BZW8 370 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LDAHQ9H6V9 325 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ABCB9Q9NP78 766 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GKN1Q9NS71 199 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 VNN3Q9NY84 501 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NEU3Q9UQ49 428 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RLFQ13129 1914 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 E9PAM4 449 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CDC7O00311 574 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GFRA2O00451 464 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 OR7A17O14581 309 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FFAR2O15552 330 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CHST10O43529 356 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SSX4O60224 188 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 UGDHO60701 494 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PAGE1O75459 146 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PEX11BO96011 259 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ADAP00813 363 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 IGHA2P01877 340 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 USP17L7P0C7H9 530 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FAM157BP0CG42 384 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CBSLP0DN79 551 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 BCKDHAP12694 445 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FOSL1P15407 271 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC6A1P30531 599 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC6A4P31645 630 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GRK5P34947 590 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CBSP35520 551 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ASMTP46597 345 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CAPZA2P47755 286 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MAPKAPK2P49137 400 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 EVX1P49640 407 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TPMTP51580 245 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ARSDP51689 593 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KCNJ10P78508 379 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 COX10Q12887 443 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ILKQ13418 452 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NFE2L1Q14494 772 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SSX1Q16384 188 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NDUFA9Q16795 377 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GALNT10Q86SR1 603 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C14orf80Q86SX3 495 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TAC4Q86UU9 113 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.16□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms