RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 GP1BAP07359 652 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 TPM2P07951 284 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 RRM1P23921 792 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 TTKP33981 857 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 TIMP3P35625 211 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 RABIFP47224 123 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 GABRB2P47870 512 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 NUMBP49757 651 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 SULT1E1P49888 294 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 DNA2P51530 1060 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 UCNP55089 124 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 C14orf177Q52M58 125 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 CARD16Q5EG05 197 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A45Q8N413 288 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 NT5C3BQ969T7 300 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 PIGVQ9NUD9 493 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.52□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 FAM72CH0Y354 149 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 K7ERQ8 282 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 FPGTO14772 594 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 FGF17O60258 216 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 CYP11B1P15538 503 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 METAP1P53582 386 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 ALFQ53S48 1182 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-204ENST00000367379 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 LINGO4Q6UY18 593 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZSR6 202 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-204ENST00000367379 FAM72BQ86X60 149 aa4.51□□□□□ -1.69
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