RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 LIPJQ5W064 366 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 NIPAL1Q6NVV3 410 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF793Q6ZN11 406 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFAF7Q7L592 441 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD37Q7Z713 158 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2E3Q969T4 207 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 FAR2Q96K12 515 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 OR51B5Q9H339 312 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM7Q9NQW5 492 aa25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 DLX3O60479 287 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 CDH13P55290 713 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 KLRB1Q12918 225 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM52Q8NDY8 209 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 METTL21AQ8WXB1 218 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM4Q9C037 500 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa25.4■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 KRT15P19012 456 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 NEK2P51955 445 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 RASA2Q15283 850 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 EMBQ6PCB8 327 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 PLPP5Q8NEB5 264 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 CAVIN3Q969G5 261 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 VPS50Q96JG6 964 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 IMMP1LQ96LU5 166 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM237Q96Q45 408 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 CSF3RQ99062 836 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 MFRPQ9BY79 579 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 EPN3Q9H201 632 aa25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TPGS1-201ENST00000359315 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 H0YIV9 168 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 UGDHO60701 494 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CYC1P08574 325 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 NUDT17P0C025 328 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 MAOAP21397 527 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 IL10P22301 178 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 NSDHLQ15738 373 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 UNC50Q53HI1 259 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 LCA5Q86VQ0 697 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 FAM47BQ8NA70 645 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 TEX19Q8NA77 164 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 WDR20Q8TBZ3 569 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 LHPPQ9H008 270 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PPCSQ9HAB8 311 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 RIC8BQ9NVN3 520 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 LUZP4Q9P127 313 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.38■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 TLDC2A0PJX2 215 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEB17A8MXT2 336 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PCDH17O14917 1159 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 B3GALT2O43825 422 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN9O95484 217 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 ETHE1O95571 254 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 GSTA1P08263 222 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PRR35P0CG20 571 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CCNG1P51959 295 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 MTTPP55157 894 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PSMF1Q92530 271 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 SERINC2Q96SA4 455 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 NTMT1Q9BV86 223 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.37■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF462Q96JM2 2506 aa25.36■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa25.36■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 CDH16O75309 829 aa25.36■■□□□ 1.65
TPGS1-201ENST00000359315 GLRA3O75311 464 aa25.36■■□□□ 1.65
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